Shaharning eski qismida “Urda” xon saroyi , 19—20-asr boshlariga oid xalq turar-joy meʼmorchiligi yodgorliklari, masjidlar, madrasalar va yodgorlik binolari saqlanib qolgan.

Qoʻqon shahridagi Moʻyi-Muborak , Tepaqoʻrgʻon , Eski Qoʻrgʻon va boshqa yodgorliklarda arxeologik tadqiqotlar olib borilganda sivilizatsiya izlari topilgan.

Moʻyi Muborakdan 5—6-asrlarga oid bir qancha loy boʻlaklari topilgan; 5—7-asrlarda monumental binoning asosi boʻlib xizmat qilgan loy platforma; 1—2-asrlarda paxsa va loy gʻishtdan qurilgan , 400 yildan ortiq xizmat qilgan qalʼa devori qoldiqlari. 5 metr chuqurlikda 2000 yilga oid materiallarga ega pastki madaniy qatlam topilgan.

Shahar markazida joylashgan Tepaqo‘rg‘onda yarim doira minorali monumental qal’aga asos bo‘lib xizmat qilgan Mo‘yi Muborakdagi kabi ilk o‘rta asrlarga oid platforma topildi.

Pastki qatlamlardan eramizdan avvalgi 2—1-asrlarga oid qizil angobali sopol idishlarning boy kolleksiyasi olingan. e. Bularning barchasini mohir shahar ustalari kulol charxida yasagan.

Umuman olganda, arxeologik materiallar Qo‘qonning qadimiy tarixi Mo‘yi-Muborak va Tepaqo‘rg‘on ostida yashiringanligidan dalolat beradi.

Olingan artefaktlar miloddan avvalgi VII asrdan kechiktirmay, deyish va taxmin qilish uchun asos bo'ladi. e. hozirgi shahar hududining ma'lum bir qismi sug'orma dehqonchilik uchun o'zlashtirilgan.

Va shahar miloddan avvalgi 2-asrning 2-yarmidan kechiktirmay paydo bo'lgan. e. va Soʻx vohasining markazi, yaʼni Fargʻona konfederal davlati tarkibiga kirgan mintaqaviy mulkning poytaxti boʻlgan (“ Xitoy yilnomalarida Davan ”).

O‘zbek Min sulolasidan bo‘lgan Qo‘qon xonlari o‘z sulolasiga qadimiylik ulug‘vorligini berishga intildi, mahalliy tarixchilar buni qunt bilan targ‘ib qildilar, bu sulolani hatto Temurlangacha kuzatib , qadimdan butun Farg‘onaga hukmronlik qilganini da’vo qildilar.

Mahalliy rivoyatlarga ko‘ra, Temur avlodidan bo‘lgan mashhur Sulton Bobur Farg‘ona orqali Samarqanddan Hindistonga ketayotgan bo‘lib, Xo‘jant va Konibodom o‘rtasidagi yo‘lda uning xotinidan biri o‘g‘il tug‘adi .

Oltun-bashik ismli bola (1545 yilda vafot etgan) u yerda aylanib yurgan o‘zbek Ming urug‘i panohida bo‘lgan (sulolaning nomi shundan). Uning kelib chiqishi ma’lum bo‘lgach, Oltun-boshik biy deb e’lon qilinadi va Asxiyga joylashadi.

Uning avlodlarida biy unvoni meros bo'lib qolgan. Altun-bashikning avlodlaridan biri Abdu-Raim Dikan-To'da qishlog'iga joylashdi, ammo keyinchalik uning asosiy yashash joyi 1732 yilda asos solgan va dastlab Iski-Qo'rg'on yoki Qal'a deb atalgan Qo'qon shahriga aylandi. -i-Raim-bai (asoschisi nomidan keyin).

Shohrux boshchiligida barpo etilgan shahar qurilishini uning o‘g‘illari Abd ar-Rahim biy va Abd al-Karim davom ettirdilar. Boy Farg‘ona vodiysiga kiraverishdagi qulay geografik joylashuvi Qo‘qonning tez o‘sishi va kengayishiga xizmat qildi. Yosh davlat bora-bora kuchayib, o‘z mulkiga ko‘proq yerlar qo‘shib bordi.

Abdukarim biy Abdurahim biyning kenja ukasi edi , u vafotidan keyin 1734 yilda Qo‘qon xonligida hokimiyatni meros qilib oldi. 1740 yilda u Qo'qonni o'rab olish uchun yangi devor qurishni buyurdi, bu keyinchalik shaharni jung'or bosqinidan himoya qilishga yordam berdi .

Qo'qon yildan-yilga rivojlangan shaharga aylandi, uning hududi tobora kengayib bordi. Venger sayyohi Vamberi Qo'qon hududi bo'yicha Xivadan olti marta, Tehrondan to'rt marta va Buxorodan ikki barobar katta ekanligini yozgan . Uning uzunligi 16 milya va kengligi besh milyaga cho'zilgan. Shahar ichida ko'chaga qaragan bo'sh loy panjarali bir qavatli turar-joy binolari ustunlik qildi.

Shaharga kirish 12 ta darvoza orqali boʻlgan, ular qayerga olib borilishiga qarab (ulardan chiqadigan yoʻllar yoʻnalishidan) nom berilgan: shimoliy Sarimozor, Ganjirov va Namangan; janubiy So‘x, Katagon va Isfara; gʻarbiy Xojent, Quduqluk va Gʻozi-Yagʻliq; sharqiy Rishton, Chimyon va Margʻilon.

Shahar toʻrt qismga ( daxa ) boʻlingan : Sarimozor, Xoʻjant, Rishton va Margʻilon. Ularning har biri 20-asr boshlarida 72 ta mahalla, jami 10 mingga yaqin xoʻjalik, 120 ta maktab (har birida 10 dan 20 tagacha talaba oʻqiydi) va 40 ta madrasadan iborat boʻlgan .

Qo'qon xonligi gullagan davrida shahar butun Farg'ona viloyatining asosiy diniy markazi bo'lgan - unda 300 dan ortiq masjidlar bo'lgan . 1870-yillarda Qoʻqonda 40 ga yaqin madrasa boʻlgan: “Mir” (1799 yilda Narbutabiy asos solgan), “Mir-Boʻtabek” (Irdanbekning oʻgʻli Mir-Boʻtabek asos solgan), “Hakim-Tyura”. (1795 yilda Hakim-Tyura asos solgan), “Xon-Xoja eshon” (1789-yilda Xon-Xoja eshon asos solgan), “Buzruk-xoja” (1801-yilda Buzruk Xoja eshon asos solgan), “Pir-Muhammad-Yasaul” (1802-yilda Pir Muhammad Yasaul asos solgan), “Xajabek” (asoschisi Xoja). (18-asr oxirida Bey), “Oxund-Divonbegi” (1805-yilda Mulla Muhammad-Oxun asos solgan), “Ming Oyim” (1802-yilda Narbut-biyning xotini Ming-Oyim asos solgan), “Jomi” (1817-yilda Umarxon asos solgan), “Mir- Boʻtabay” (1827 yilda tashkil etilgan), “Xoja-Dadxa” (1822-yilda Buzruk-xoja eshon asos solgan), “Madalixon” (1829-yilda Muhammad Alixon asos solgan), “Hokim-Oyim” (1869-yilda xonning onasi sharafiga asos solingan), “Sulton Murod- bek» (y. Sheralixonning oʻgʻli Sulton Murodbek asos solgan 1872)